ＡＩとエコバイオ
深層学習 TensorFlow Windows, Eclipse, PyDev, Java
2018年5月30日 ＡＩとエコバイオ
ディープラーニングの学習や研究では Python を使うことが多いですが、学習済みモデルを活用したアプリケーション開発を想定して、アプリケーション開発でよく使われる Windows, Eclipse, Java で Te …
AI課題1：DNA相同性検索とAI(3) 16SrDNA塩基配列で細菌分類(2)
2018年5月8日 ＡＩとエコバイオ
（「DNA相同性検索とAI(2) 16SrDNA塩基配列で細菌分類」の続きです。） 全結合で単純に階層を増やす方法でどの程度まで精度を上げられるか試してみました。 基本的なパラメータは前回と同じで、以下の条件でテストしま …
深層学習 TensorFlow GPU を入れてみました
2018年5月1日 ＡＩとエコバイオ
CPU のみでの学習には時間がかかるので、グラフィックボードを購入して Tensorflow GPU版を試してみました。 NVIDIA社 の CUDA と cuDNN は、グラフィックボードの GPU（Graphics …
AI課題1：DNA相同性検索とAI(2) 16SrDNA塩基配列で細菌分類
2018年3月24日 ＡＩとエコバイオ
SSearch, blast や ClastalW のようなプログラムを利用して、16SrDNA塩基配列で細菌の分類を目的として相同性検索と系統樹作成を行うことは、細菌研究ではよくおこなわれています。 従来 …
深層学習 TensorFlow Windows版 インストール
2018年3月5日 ＡＩとエコバイオ
TensorFlow には Windows版があるのでパソコンにインストールしてみました。 PC環境は少し古いスペックですが、Windows 7 64bit、CPU Core2duo 2.53GHz、メモリ 4GB で試 …
深層学習 TensorFlow を MNIST で試す(2)
2018年2月12日 ＡＩとエコバイオ
（前回の続きです） ※tflearnの参考ページ http://tflearn.org/getting_started/ 前回は全結合型ネットワークを試してみましたが、今回は畳み込みネットワークを試してみま …
深層学習 TensorFlow を MNIST で試す
2018年2月5日 ＡＩとエコバイオ
MNIST とは手書きの数字のモノクロ画像データでAI画像認識の練習用によく使われています。 MNIST の Web ページを見ると、学習用で 60,000, テスト用 10,000 の手書き文字データが利用できるそうで …
深層学習フレームワーク TensorFlowのインストール
2018年1月27日 ＡＩとエコバイオ
ディープラーニング（深層学習）の無償のフレームワークには、Caffe, Chainer, TensorFlow などがあります。 まず試しに TensorFlowをインストールしてみました。 TensorFlowは Go …
ＡＩ課題１：ＤＮＡ相同性検索とＡＩ（１）
2017年11月15日 ＡＩとエコバイオ
ＤＮＡ相同性検索では古くから厳密なアルゴリズム（問題解決法）として Ssearch が利用されてきました。 Ssearch は厳密だが時間がかかるので現在では、結果が早く得られる blast が多く使われています。 例と …
ＡＩ（人口知能）とは？
2017年11月4日 ＡＩとエコバイオ
エコ・バイオでＡＩ（人口知能）が使えるかとうかと考えて、ＡＩに関する調査と検討してみようと思っています。 ＡＩ一般論から、エコバイオでの応用などについて考えていきます。 目的は環境・バイオでのＡＩの活用ですが、まずは一般 …
